Clemens Pustejovsky war nach dem Studium in München und Freiburg zunächst in Brüssel und Dubai tätig, bevor er sich in Freiburg als Rechtsanwalt niedergelassen hat. Von hier aus begleitet und berät er seit nahezu 20 Jahren regional wie international Unternehmen und Privatpersonen. Ein Schwerpunkt der Tätigkeit von Prof. Clemens Pustejovsky stellt die Beratung von Unternehmen im Gesellschaftsrecht wie beispielsweise bei Gründung, Veräußerung und Umstrukturierung von Unternehmen und Konflikten dar. Er berät und vertritt zudem zahlreiche Vereine und Stiftungen, auch im Gemeinnützigkeitsrecht. Clemens Pustejovsky ist in Aufsichtsräten und anderen Gremien juristischer Personen vor allem aus der Medien- und Kulturbranche tätig.
Im Arbeitsrecht konzentriert sich Clemens Pustejovsky auf die Beendigung von Arbeitsverhältnissen und die dabei gerade aus Unternehmensperspektive auftretenden Themen sowie Fragen des Beschäftigungsdatenschutzes. Lange vor Inkrafttreten der DSGVO war Clemens Pustejovsky als Gutachter, Dozent und Berater im Datenschutzrecht tätig und für verschiedene Unternehmen externer Betrieblicher Datenschutzbeauftragter. In Fragen des gewerblichen Rechtsschutzes (Markenrecht, Designrecht), des IT-Rechts und des Wettbewerbsrechts, ebenso wie in Fragen des Medien-, Presse- und Urheberrechts, berät Clemens Pustejovsky Verlage, (Werbe-) Agenturen und andere Unternehmen. Zudem vertritt er sowohl Medienunternehmen als auch – prominente – Betroffene in Fragen des Persönlichkeitsschutzes sowie der Bildrechte.
Vor dem Hintergrund eigener musikalischer Erfahrungen berät Prof. Clemens Pustejovsky national wie international CD-Labels, Rundfunkanstalten, Opernhäuser, Festivals, Orchester, Chöre, Ensembles und Musizierende in sämtlichen Fragen des Musikrechts – von Vertragsgestaltung, Urheber- und Lizenzrecht (inkl. GEMA, GVL, VG Musikedition) und Künstlersozialversicherungsrecht bis hin zum Steuerrecht. Prof. Clemens Pustejovsky ist gefragter Dozent und Prüfer für Datenschutzrecht, Wettbewerbsrecht, Medienrecht etc. bei verschiedenen staatlichen und privaten Institutionen und hält Inhouse-Seminare in renommierten Unternehmen. Außerdem ist er Honorarprofessor für Musikrecht und Musikmanagement an der Musikhochschule Freiburg, Lehrbeauftragter für Presse. Medien- und Urheberrecht an der Albert-Ludwigs-Universität und Gastdozent an anderen Universitäten.